不过，奴儿干都司只是羁縻性质的都司。朝廷册封当地部落首领为都督、都指挥、指挥、千百户、都指挥使、镇抚等，赐给敕书印记，使其名义上属于大明，实际上，除了表示臣服，按惯例纳贡外，并不能有效管理。万历时，奴儿干都司属下共有卫三百八十四、所二十四、地面七、站七、寨一。
大大小小几百个部落，争相向大明进贡，大大满足了大明皇帝的虚荣心。只是，封赏这么多部落太费银子了！宣德时，不再招抚奴儿干诸部；正统年间撤废奴儿干都司；不过虽然撤废，一直到万历年间，奴儿干都司这个名称，都经常出现在大明朝的各种文书中。
朝觐是天朝上国的政治需要，为了方便这些部落来北京朝觐，奴儿干都司的栈道修了足足五千里，只是奴儿干都司衙门已经撤废，朝贡的事，由辽东都司代管。
一直到万历后期，萨尔浒之战后，朝贡的路断了，奴儿干都司作为一个地理概念，才最终消失。
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在阿伊努长老库西利的帮助下，邝露顺利地招抚了南部的几个阿伊努部落，随行的还有一些大明、朝鲜商人，和他们进行贸易，交换商品。
不过招抚苦兀岛北方的费雅喀（尼夫赫）人、中部的鄂温克人、中、南部的赫哲人时，却遇到了麻烦。
这三族与满清关联很深，费雅喀六姓、一半的鄂温克、赫哲部落被满清编了户，每年都参与赏乌林，因此，大多不愿意背清降明。
阮进的军中有一百多名鄂温克、赫哲族降兵，派这些人去劝降，不听劝便打，恩威并施，在铲平了两个鄂温克部落、三个赫哲部落后，岛上的鄂温克、赫哲部落全部归顺了。
明军将俘获的六千鄂温克、赫哲族人口，迁至中部的兀烈河东岸，建起了兀烈河城、兀烈河港。
然后，继续向北，讨伐费雅喀人。费雅喀人与阿伊努人一样，也属于外来人种，与通古斯人相比，色素更深，轮廓突出。
这些蛮人十分凶猛，阮进费了好大劲，损失了七十多名士兵，才攻破了亲满的六个费雅喀部落，将费雅喀六姓全置于统治之下，又获四千多人口，在北部设囊哈儿城、囊哈儿港。
邝露又令归顺的部落每年缴纳少许特产，充作赋税，在南部建波罗河城、波罗河港。
至此，苦兀岛四族十余万人口，皆在明军控制之下。
阮进从各族人口中，招募了一千三百名战士，摩拳擦掌，准备渡过鞑靼海峡，攻取奴儿干城。
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